EL HIV Sida, la variabilidad genetica

EL HIV Sida, la variabilidad genetica

La variabilidad genética

Más información: Los subtipos del VIH

El árbol filogenético de la SIV y VIH

VIH difiere de muchos virus, ya que tiene muy alta la variabilidad genética . Esta diversidad es una consecuencia de su rápido ciclo de replicación , con la generación de alrededor de 10 ¹⁰ viriones cada día, junto con una alta tasa de mutación de aproximadamente 3 x 10 ^-5 por base de nucleótido por ciclo de replicación y recombinogénicas propiedades de la transcriptasa inversa.

^{[ 56 ] [ 57 ] [ 58 ]}Este escenario complejo conduce a la generación de muchas variantes del VIH en un solo paciente infectado en el curso de un día.

^[ 56 ] Esta variabilidad se agrava cuando una única célula se infecta simultáneamente por dos o más cepas diferentes de VIH. Cuando se produce la infección simultánea, el genoma de los viriones progenie puede estar compuesta de cadenas de ARN a partir de dos cepas diferentes. Esta virión híbrido luego infectar una nueva célula donde se somete a la replicación. Mientras esto sucede, la transcriptasa inversa, saltando hacia atrás y adelante entre las dos plantillas de ARN diferentes, se genera un retrovirus recién sintetizado secuencia de ADN que es un recombinante entre los dos genomas parentales. 

^[ 56 ] Esta recombinación es más evidente cuando se produce entre subtipos. 

^[ 56 ]La estrecha relación del virus de inmunodeficiencia en simios (SIV) se ha convertido en muchas cepas, que se clasifican por las especies huéspedes naturales. Cepas de SIV del mono verde africano (SIVagm) y mangabey tiznado (SIVsmm) se cree que tienen una larga historia evolutiva con sus anfitriones. Estos anfitriones se han adaptado a la presencia del virus,

 ^[ 59 ] , que está presente en altos niveles en la sangre del huésped, pero evoca sólo una respuesta inmune leve, 

^[ 60 ] no causa el desarrollo de simio SIDA, 

^[ 61 ] y no se someterse a la extensa mutación y recombinación típica de la infección por VIH en seres humanos. 

^[ 62 ]En contraste, cuando estas cepas infectan especies que no se han adaptado a SIV (anfitriones "heterólogo" tales como rhesus o cynomolgus macacos), los animales desarrollan el SIDA y el virus genera diversidad genética similar a lo que se ve en la infección humana VIH. 

^[ 63 ] Chimpancé SIV (VIS), el pariente más cercano genética del VIH-1, se asocia con mayor mortalidad y síntomas similares al SIDA en su huésped natural. 

^[ 64 ] VIScpz parece haber sido transmitido hace relativamente poco a los chimpancés y las poblaciones humanas, por lo que sus anfitriones aún no se han adaptado al virus. 

^[ 59 ] Este virus también ha perdido una función de la Nef gen que está presente en la mayoría de los SIV, sin que esta función, el agotamiento de las células T es más probable, que conduce a la inmunodeficiencia. ^[ 64 ]

Tres grupos de VIH-1 se han identificado sobre la base de diferencias en la envoltura ( env ) de la región: M, N, y O. 

^[ 65 ] Grupo M es el más prevalente y se subdivide en ocho subtipos (o clados ), basado en todo el genoma, que son geográficamente distintos.

 ^[ 66 ] La más frecuente son los subtipos B (que se encuentran principalmente en América del Norte y Europa), A y D (que se encuentra principalmente en África), y C (que se encuentra principalmente en África y Asia); estos subtipos forman ramas en el árbol filogenético que representa el linaje del grupo M del VIH-1. La coinfección por subtipos distintos da lugar a formas recombinantes circulantes (FRC). En 2000, último año en que se realizó un análisis de la prevalencia del subtipo global, el 47,2% de las infecciones en todo el mundo fueron del subtipo C, 26,7% eran de A/CRF02_AG subtipo, el 12,3% fueron del subtipo B, 5,3% fueron del subtipo D, 3,2% eran de CRF_AE, y el 5,3% restante se compone de otros subtipos y CRF. 

^[ 67 ] La mayoría de VIH-1 investigación se centra en el subtipo B;. pocos laboratorios se centran en los otros subtipos 

^[ 68 ] La existencia de un cuarto grupo de , "P", se ha planteado la hipótesis basada en un virus aislado en el año 2009. 

^[ 69 ] La cepa es aparentemente deriva de gorila SIV (SIVgor), aislado por primera vez desde los gorilas occidentales de tierras bajas en 2006. 

^[ 69 ]La secuencia genética del VIH-2 es sólo parcialmente homóloga a VIH-1 y más estrechamente se parece al de SIVsmm.